2 военный клинический госпиталь войск национальной гвардии Российской Федерации был сформирован

9  февраля 1993 года на основании приказа МВД РФ  на базе военного госпиталя Министерства обороны в

городе Нальчике.

Основные этапы истории:

Формирование в Нальчике. Военный госпиталь внутренних войск МВД России вошел в состав 54-й ордена Красной Звезды дивизии оперативного назначения внутренних войск МВД России.

Передислокация в Пятигорск. В апреле 1998 года основные подразделения госпиталя переведены в город Пятигорск на базе этого учреждения и гарнизонной поликлиники.

Реформирование в 2005 году. На основании приказа Главнокомандующего внутренними войсками МВД России госпиталь реформирован с расширением коечной мощности и созданием реабилитационно-восстановительного центра.

Переподчинение в 2006 году. С 1 декабря 2006 года военный госпиталь стал воинской частью непосредственного подчинения командующему войсками Северо-Кавказского регионального командования ВВ МВД России.

Очередное реформирование в 2011 году. На основании приказа Главнокомандующего ВВ МВД России произошло очередное реформирование военного госпиталя. Был сокращен реабилитационно-восстановительный центр, в состав госпиталя введены психиатрическое и инфекционное отделения. В этом же году военному госпиталю было присвоено специальное название – «2 военный  госпиталь внутренних войск Министерства внутренних дел Российской Федерации».

Переименование в 2016 году. В июле 2016 года, после создания войск национальной гвардии, госпиталь был переименован во 2 военный клинический госпиталь войск национальной гвардии Российской Федерации.

В истории учреждения есть и особые страницы. Например, с ноября 2019 года госпиталь частично был перепрофилирован для лечения пациентов с новой коронавирусной инфекцией. А за самоотверженный труд в «красной зоне» ряд медиков был удостоен государственных наград - медали Луки Крымского.

В настоящее время 2 военный клинический госпиталь войск национальной гвардии Российской Федерации это многофункциональное медицинское учреждение, оснащенное современным диагностическим и лечебным оборудованием. Его основа – сложившийся коллектив профессионалов, каждый из которых достойно представляет свое направление в медицине. За последние годы произошли коренные изменения по улучшению материально-технической базы, бытовых условий, оснащением современным медицинским оборудованием военного госпиталя.